Sony Xperia E5 pracuje w systemie Android 6.0 Marshmallow. W środku znajduje się czterordzeniowy procesor MediaTek MT6735 z układem graficznym Mali-T720 MP2. Model ma 1,5 GB pamięci operacyjnej i 16 GB pamięci wewnętrznej, którą można rozszerzyć dzięki karcie microSD o 200 GB.